Als zijnde Cole was het de bedoeling dat je een pakje af zou leveren in de downtown regio van Empire City. Wanneer je echter ter nauwernood een gigantische explosie overleeft, tref je je nadien ineens in een stadsdeel, wat is afgesloten van de buitenwereld.

Zware criminelen en relschoppers bepalen het straatbeeld en je komt er achter dat de explosie een aantal lichamelijke side-effects hebben gehad. Je lichaam blijkt te beschikken over enorme nieuwe krachten. Een televisie uitzending heeft Cole gelinkt aan de explosie... nu ben je een gezochte man, zonder dat je wat te maken had met het gebeurde. Terwijl je een poging onderneemt totale chaos in Empire City te voorkomen, probeer je de nieuwe krachten te beheersen en onder controle te krijgen.